摩尼殿始建于北宋皇祐四年（1052年），大殿布局奇特，其正方形殿身的四面正中各出一山花向前的歇山式抱廈，使平面形成十字形。檐下斗拱宏大，分布疏朗；柱子用材粗大，有明顯的卷剎、側(cè)角和生起，與宋《營造法式》相近。我國古建筑專家梁思成先生稱這種布局平時除去北京故宮紫禁城角樓外，只在宋畫里見過。并特意將其拍照，編入《中國建筑史》。解放前由于年久失修，大殿梁架傾斜嚴(yán)重，1977年至1980年由國家文物局撥款對這座大殿進行了復(fù)原性修復(fù)。

殿內(nèi)佛壇上供奉五尊泥塑金裝佛像，正中是佛祖釋迦牟尼，他是佛教的創(chuàng)始人，與我國春秋時期的孔子是同時期人，本名為悉達多?喬達摩。原是迦毗羅衛(wèi)國的太子，后為弄清人生真諦而出家悟道，創(chuàng)立佛教后，被人稱為佛陀。左右兩側(cè)立像為釋迦牟尼十大弟子中的其中兩位。左側(cè)的老者為迦葉，右側(cè)的為阿難，兩側(cè)蓮座上供奉的是文殊、普賢二菩薩。這五尊均都為宋代原塑，文殊、普賢在明代曾進行過修補。殿內(nèi)各壁為佛教故事為題材的壁畫，現(xiàn)存面積仍為422平方米。內(nèi)槽東西扇面墻內(nèi)壁繪“十二圓覺菩薩”和“八大菩薩”；四抱廈繪護法“二十四尊天”，其中東抱廈的“大悲尊天”、“鬼子母天”等保存較好；檐墻內(nèi)壁生動地描繪了佛祖釋迦牟尼降生、出家、苦行、成道、涅槃等整個過程，稱“釋氏源流”；東西扇面墻分別繪“西方勝境”和“東方凈琉璃世界”。

摩尼殿內(nèi)槽北壁為一座泥塑五彩懸山，懸山中現(xiàn)存塑像共30余身，其中最引人注目的是正中的五彩觀音菩薩像，俗稱“倒座觀音”。因觀音菩薩有“眾生普渡不完，誓不回頭”的誓言，而蕓蕓眾生，永遠普渡不完，故形成“倒座觀音”形象。觀音姿態(tài)優(yōu)雅端莊，面容秀麗恬靜，那雙智慧深藏的眼睛微微俯視，恰與虔誠的禮佛者形成感情的交流。觀音像原塑于北宋，明嘉靖四十二年（1563年）曾進行過修補。魯迅先生非常欣賞這尊塑像，稱贊她是“將神人格化”了，將她視若佛教美學(xué)的代表作而珍藏，至今仍陳放于北京阜城門內(nèi)魯迅故居的書案上，被視為最美的觀音。